Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF5Q12774 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF5Q12774 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms