Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBRQ0VD83 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBRQ0VD83 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms