Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CREMQ03060 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREMQ03060 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREMQ03060 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms