Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF8Q02556 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms