Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CYP27A1Q02318 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CYP27A1Q02318 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms