Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MC1RQ01726 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms