Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms