Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB1P82279 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms