Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms