Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRISP1P54107 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRISP1P54107 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms