Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX2P50458 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX2P50458 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX2P50458 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX2P50458 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX2P50458 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX2P50458 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX2P50458 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX2P50458 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX2P50458 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LHX2P50458 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms