Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSK3BP49841 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms