Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLK1P49759 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms