Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CASP4P49662 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP4P49662 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP4P49662 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP4P49662 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP4P49662 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP4P49662 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP4P49662 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms