Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MCAMP43121 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MCAMP43121 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MCAMP43121 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MCAMP43121 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MCAMP43121 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms