Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOBEC1P41238 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms