Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CAPGP40121 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms