Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP6V1E1P36543 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP6V1E1P36543 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms