Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM23P36406 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms