Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHI3L1P36222 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHI3L1P36222 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms