Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTGER4P35408 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTGER4P35408 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms