Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms