Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX2P28328 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX2P28328 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms