Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABRR1P24046 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRR1P24046 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms