Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPHA1P21709 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EPHA1P21709 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EPHA1P21709 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
EPHA1P21709 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EPHA1P21709 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
EPHA1P21709 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EPHA1P21709 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms