Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB7P09629 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB7P09629 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms