Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOC1P02654 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC1P02654 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms