Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC24BO95487 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms