Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
E2F6O75461 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
E2F6O75461 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms