Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN2BO60939 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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