Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRPF3O43395 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms