Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCAO15360 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCAO15360 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCAO15360 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCAO15360 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCAO15360 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCAO15360 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCAO15360 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCAO15360 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCAO15360 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms