Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EBAG9O00559 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EBAG9O00559 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms