Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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