Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BHMG1C9JSJ3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms