Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CLDN25C9JDP6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CLDN25C9JDP6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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