Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MEIS3P1A6NDR6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms