Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PIPSLA2A3N6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIPSLA2A3N6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms