Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
LAMC3Q9Y6N6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
LAMC3Q9Y6N6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC43.03■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
LAMC3Q9Y6N6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC43■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC42.99■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC42.98■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC42.95■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
LAMC3Q9Y6N6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC42.92■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC42.9■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
LAMC3Q9Y6N6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
LAMC3Q9Y6N6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms