Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX11Q9Y5W9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX11Q9Y5W9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX11Q9Y5W9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms