Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF2Q9Y5W3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KLF2Q9Y5W3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLF2Q9Y5W3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms