Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNPO3Q9Y5L0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNPO3Q9Y5L0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNPO3Q9Y5L0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNPO3Q9Y5L0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms