Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NRXN3Q9Y4C0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NRXN3Q9Y4C0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NRXN3Q9Y4C0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms