Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHTOPQ9Y3Y2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms