Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1Q9Y3L3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SH3BP1Q9Y3L3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms