Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSUH2Q9Y2M2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SSUH2Q9Y2M2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSUH2Q9Y2M2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSUH2Q9Y2M2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms