Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPH3AQ9Y2J0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPH3AQ9Y2J0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPH3AQ9Y2J0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms