Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC9A8Q9Y2E8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A8Q9Y2E8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC9A8Q9Y2E8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms