Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC4Q9Y296 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC4Q9Y296 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC4Q9Y296 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC4Q9Y296 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms