Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFSF13BQ9Y275 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFSF13BQ9Y275 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms